In 1961 werd Marie-Anne Asselberghs directeur van het Nederlands Spoorwegmuseum in Utrecht, als opvolger van haar vader. Hij bekleedde die functie al sinds 1928.
Onder haar leiding werd de collectie fors uitgebreid en nam het aantal bezoekers toe van enkele tienduizenden per jaar tot meer dan 150.000 per jaar bij haar vertrek in 1984.
De laatste jaren van haar leven had zij meer afstand van het museum genomen, omdat zij het museum "teveel een pretpark vond geworden".
Naast haar functie als museumdirecteur heeft zij zes boeken geschreven over spoorweghistorie.
Zij is op dinsdag 15 januari 2013 overleden te Utrecht.